Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse
Human Proteome Resource
Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse beslöt 2002 att stödja en omfattande kartläggning av mänskliga proteiner, Human Proteome Resource (HPR), med Mathias Uhlén, Kungl Tekniska högskolan, som huvudman. Målet var att under en 4-årsperiod definiera och lokalisera de proteiner som styrs av c:a 25 % av den mänskliga arvsmassans drygt 20.000 gener och att identifiera i vilka av kroppens celler som de fungerar.
I november 2005 och i mars 2006 beviljades ytterligare stöd till projektet. Fortsättningsanslaget avser kompletterande stöd för att kunna öka hastigheten i proteomanalysen och för att under ytterligare c:a 3 år kunna identifiera 50 % av det mänskliga proteomet som styrs av icke-polymorfa gener.
Projektbeskrivning
HPR-projektet engagerar för närvarande 55 forskare och tekniska assistenter med en planerad utökning till drygt 70 heltidsanställda. Projektet är inriktat på att analysera de proteiner som styrs av genfamiljer och kromsomregioner som innehåller biologiskt och medicinskt speciellt intressant information. Projektet har även utvidgats till att omfatta förekomst av olika proteiner i vävnader från flera olika patientgrupper med fokus på proteiner som förekommer i cancerceller, celler i centrala nervsystemet och sådana som har betydelse för nybildning av blodkärl.
Doktor Henrik Wernérus och professor Sophia Hober, projektledare inom HPR.
I HPR projektet utnyttjas en känd gensekvens för att bygga en syntetisk DNA molekyl som ska styra bildningen av en del av ett protein. Lokaliseringen av detta genfragment inom hela den gensekvens som kodar för proteinkedjan väljs så att den ska styra bildningen av en peptid, som skiljer sig maximalt från andra möjliga proteiner. Detta görs för att antikropparna endast ska reagera med det aktuella proteinet. När det gäller kända gener, som varierar mellan individer, identifieras sådana delar av DNA sekvensen som är lika inom familjen, för att möjliggöra upptäckt i vävnader från olika individer.
HPR leds av en styrelse med ansvar för övergripande strategier för projektet. Ett vetenskapligt råd bestående av internationella experter utvärderar de vetenskapliga framstegen och ger råd om nya utvecklingsområden och externa samarbeten. Prioriteringskommittén består av medlemmar från projektledningen och styrelsen med ansvar för prioritering mellan olika externa samarbetsprojekt.
Projektomfattning
Ambitionen är att definiera hälften av arvsmassans "vanliga" gener. Av dessa antikroppsreagenser kommer knappt 8000 att vara framställda inom projektet, resten att utgöra analys av kommersiellt tillgängliga antikroppar. Inriktningen gäller främst de genfamiljer och kromosomregioner som innehåller speciella biologiskt eller medicinskt intressanta genfamiljer. Förslag till sådana studier kommer från externa forskare, och bland dem som fått lämna förslag till projekt finns både svenska och utländska forskare. Alla externa förslag har granskats av HPRs prioriteringskommitté.
Den internationella konkurrensen är stor med flera projekt runt om i världen, bl.a. HUPO (Human Proteome Organisation) i Europa, projekt i Kina och USA, även kommersiella projekt vilka inriktas mot att definiera delar av det humana "proteomet".
I den utökade studien kommer särskilt intresse att ägnas olika typer av cancertumörer genom ett nybildat nätverk av svenska forskare, som leds av Kenneth Nilsson, Uppsala universitet. Dessutom kommer en särskild hjärnatlas att utarbetas av Thomas Hökfelt, Karolinska institutet liksom en atlas över reaktioner på vävnader från apor, en primatatlas, av Svante Pääbo, Tyskland.
Sedan slutet av augusti 2005 har resultat från projektet gjorts allmänt tillgängliga. Adressen till hemsidan är www. proteinatlas.org. I denna databas finns över 400.000 bilder tillgängliga där hittills över 700 olika antikroppar, många kommersiella, analyserats för upptäckt av tidigare kända men också helt nya proteiner. Antikroppsreaktioner på vävnader från olika organ och från flera olika individer har analyserats och bedömts av kunniga patologer och samtliga reaktioner har beskrivits (annoterats).
“ ...avsikten med fortsättningsanslaget är att kunna öka aktiviteten i projektet för att de svenska forskarna och Sverige inte ska förlora sin ledande ställning... ”
Kommentarer:
- Genom HPR-projektet har Sverige fått en världsledande ställning inom den internationella proteinforskningen. Projektet har bedrivits med stor öppenhet gentemot omvärlden och många utomstående forskare har uttryckt sin stora tillfredsställelse med möjligheten till samarbete och personlig forskningsfördel genom att få tillgång till data och reagenser för den egna forskningen, säger professor Erna Möller, verkställande ledamot i Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse.
- Det finns idag ett stort globalt intresse för forskningsområdet och omfattande resurser både i Europa, Kina och USA inriktas mot proteinforskningen. Avsikten med fortsättningsanslaget är att kunna öka aktiviteten i projektet för att de svenska forskarna och Sverige inte ska förlora sin ledande ställning, säger Peter Wallenberg Jr. - vice ordförande i Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse.
- Det är oerhört glädjande att Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse stöder en andra fas av HPR-projektet. Med detta anslag möjliggörs både en breddning och fördjupning av programmet och det gör att vi nu kan accelerera kartläggningen av människans proteiner inom ramen för detta svenska initiativ. Anslaget innebär också att Sverige även i fortsättningen kan ha värdskapet för en publik human protein atlas (www.proteinatlas.org) tillgänglig för medicinsk forskning, säger professor Mathias Uhlén.
Fakta
HPR projektet har totalt beviljats 450 miljoner kronor i anslag. Projektet bedrivs vid AlbaNova universitetscentrum, Kungl Tekniska högskolan samt vid Rudbecks-laboratoriet, Uppsala universitet. Drygt 70 forskare är engagerade i projektet.
Projekt
Här presenterar vi projekt som får forskningsbidrag.
Ekologiska institutionen vid Lunds universitet har erhållit bidrag om totalt 2,6 miljoner kronor till laserutrustning. Läs mer
Stiftelsen har anslagit 50 miljoner kronor till stöd för programmet vars totala omfattning är högst 72,5 miljoner kronor under en femårsperiod. Läs mer
Lunds universitet och Karolinska Institutet beviljades 2006 ett anslag om 20 miljoner kronor till ett forskningsprogram om Parkinsons sjukdom. Läs mer
Aktuellt
Här hittar all aktuell information från stiftelsen. Våra pressmeddelanden, kommunikéer, våra beviljade anslag, våra stipendiater och även årsredovningar. Gå till aktuellt.
